Ved SLIT er det liten fare for alvorlige allergiske reaksjoner/anafylaksi ved behandling for allergisk rhinitt. Pasienter som har hatt alvorlige reaksjoner ved SCIT kan imidlertid ha økt sjanse for lignende reaksjoner ved SLIT. SLIT er trygt for pasienter med mild-moderat astma, men risiko ved bruk til pasienter med alvorlig eller ukontrollert astma er foreløpig uavklart og bør unngås.